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尊龙凯时分子克隆实验流程与定点突变注意事项

来源:濮阳丽娜 日期:2025-03-26

尊龙凯时在生物医疗领域中的定点突变实验流程包括引物设计、PCR扩增、产物消化、纯化以及重组反应等多个步骤。以下将对这些步骤进行详细介绍。

尊龙凯时分子克隆实验流程与定点突变注意事项

一、引物设计与PCR扩增

引物设计是定点突变的重要环节。要求如以下几点:

  • 引物长度应为5’-15-21bp的反向互补区域加上至少15bp的非互补区域-3’。
  • 反向互补区域的GC含量需在40%-60%之间,待突变位点至引物3'端的Tm值应为60°C。
  • 根据实验需求选择合适的模块进行引物设计。
建议使用与试剂盒配套的扩增模块进行PCR扩增,优化退火温度与反应体系。对于PCR扩增体系,推荐在50μl的体系中使用1ng的模板质粒,并控制扩增循环数不超过35个。

二、扩增产物的消化与纯化

扩增完成后,进行DpnI消化与纯化:

  1. 取5μl扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳鉴定,观察是否有预期大小的条带。在确认存在目标条带后,其余产物进行DpnI消化(将45μl扩增产物与1μl DpnI混合,在37°C下反应1-2小时后,再进行70°C下反应15分钟以失活DpnI)。
  2. 建议采用切胶回收法进行纯化,切胶时间应控制在3分钟内,以减少紫外线对DNA的损伤。使用NanoDrop/OneDrop等仪器检测回收浓度,要求≥20ng/μl,并通过跑胶确认回收产品的单一性。
  3. 如果回收浓度较低,可通过增加反应体系,采用多管反应单管回收的方法,提高浓度。

三、重组反应

重组反应步骤如下:

  1. 连接反应体系中的各组分投入量应严格按照说明书计算,若浓度过高,可以适当稀释。
  2. 连接反应程序需遵循说明书指示,建议在PCR仪中进行反应。

四、感受态细胞转化

转化步骤包括:

  • 选择使用DH5α或Fast-T1等化学感受态细胞,切忌重复冻融使用,建议在-80°C取出后一次性用完。
  • 连接产物与感受态细胞的体积比例建议为1:10,通常推荐10μl重组产物加入到100μl的感受态细胞中。
  • 热激时间应按照感受态细胞的说明书进行,平板上使用的抗生素需与转化载体的抗性一致。
  • 菌液涂板的操作:将菌液离心后,去除多余LB培养基,保留100μl重悬液进行涂板。

五、常见问题分析

在定点突变过程中,可能会遇到一些常见问题:

  1. 引物设计问题:反向互补区域应为15-21bp,GC含量要保持在40%-60%之间。建议使用尊龙凯时的CEDesign在线工具进行推荐设计。
  2. 质粒模板质量问题:通过电泳检测质粒模板的状态,若发现条带异常,需重新制备模板。
  3. PCR反应设置不当:过量的模板会抑制反应,建议在50μl体系中使用1ng模板。对于较长的质粒,可考虑使用双/多点突变策略进行分段扩增。
  4. 非目标位点的突变:若突变位于引物区域,需重新合成引物;如果在其他部位,则应使用高保真酶重新制备模板。

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